Diferentes modos do analisador por XRF são usados para testar diferentes tipos de amostras. Por exemplo, o modo de liga é usado para analisar vários tipos de ligas, o modo de mineração é usado para detectar diferentes tipos de minério de ferro, minério de cobre, minério de titânio, minério de chumbo, etc., e o modo de metal precioso é usado para testar amostras contendo metais preciosos como Au, Ag e Pt como elemento principal. Diferentes modos de análise são projetados para diferentes aplicações.